Seurakunnanvaltuusto käyttää ylintä päätösvaltaa ja edistää seurakunnan hengellistä elämää sekä ohjaa ja arvioi seurakunnan strategisia linjauksia.
Joensuun ortodoksisen seurakunnan seurakunnanvaltuustoon jäsenet kaudelle 2021 – 2023 ovat:
| Matti Tolvanen, pj. Veli Jeskanen, 1. vpj. Kirsi Jaskanen, 2. vpj. Tuomas Järvelin, kirkkoherra Matti Jeskanen Merja Kuukkanen Maire Kärkkäinen Svetlana Loginova Seija Mantsinen Petri Nykänen Timo Nykänen | Annakaisa Onatsu Sakari Petsalo Oiva Puruskainen Jouni Ratilainen Olavi Reittu Kirsi Ryynänen Eija Räsänen Virpi Sidoroff Sirkka Vepsä Kirsi Vuomajoki Markku Ylönen |